Organistens hovedopgaver er at medvirke musikalsk ved Folkekirkens gudstjenester, kirkelige handlinger, samt være medansvarlig for sognets musikalske liv i form af koncerter, musikaftener og møder med fællessang og / eller musikindslag. En tilsvarende vigtig opgave er at lede kirkens kor, hvor sangerne kan være voksne eller børn, professionelle eller amatører. Musikalske lederevner er nødvendige for korarbejdet, der tillige kræver såvel pædagogisk indsigt som sociale egenskaber.
Der kan ligeledes være klokkespil knyttet til organistens stilling.

Endelig har organisten tilsynet med kirkens instrumenter, og skal kunne vejlede menighedsrådet med løbende vurderinger af instrumenternes tilstand og pasning.